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Type cellulaire qui exprime 90% du génome


Les cellules différenciées expriment les gènes nécessaires à leur propre usage. J'ai entendu dire que certains types de cellules expriment environ 90 % des 30 000 protéines codées dans le génome. Quelqu'un peut-il me dire quel est ce type de cellule?


Bon, j'ai trouvé ce papier :

Danan-Gotthold M, Guyon C, Giraud M, Levanin EY, Abramson J. 2016. L'édition et l'épissage étendus de l'ARN augmentent la diversité de l'auto-représentation immunitaire dans les cellules épithéliales thymiques médullaires. Génome Biol 17:219.

Les cellules épithéliales thymiques médullaires [mTEC] expriment environ 85 % de l'ensemble du génome codant

… pour mieux déterminer la fraction de gènes exprimés dans les mTEC et autres tissus de souris, nous avons profité de la technologie RNA-seq… L'analyse… a révélé que la plupart des tissus [voir ci-dessous pour ceux testés] expriment 12 000 à 14 000 gènes (soit 60- 65 % du génome codant). Le poumon et deux sites immunologiquement privilégiés, le cerveau et les testicules, étaient les seuls tissus qui exprimaient une fraction plus importante du génome, de l'ordre de 70 à 75 %… Conformément à d'autres études récemment publiées, le mTECsalut La population a exprimé près de 18 000 gènes, ce qui représente environ 85 % du génome codant, tandis que les mTEC déficients en Aire (AireKO) ont exprimé environ 15 000 gènes, suggérant qu'Aire est responsable de l'induction d'environ 3 000 gènes dans les mTEC. Fait intéressant, même en l'absence d'Aire, les mTEC ont exprimé une fraction relativement importante du génome (~ 75 %), dépassant considérablement l'expression globale du génome dans d'autres tissus périphériques. Fait intéressant, ni [cellules épithéliales thymiques corticales] ni [cellules épithéliales cutanées] n'ont démontré une expression globale du génome plus élevée que d'autres tissus, ce qui suggère que l'expression génique de promiscuité est en effet unique à la population de mTEC.

Ces cellules expriment un si large complément de protéines car elles sont impliquées dans la maturation des cellules T, en particulier la sélection négative.


Liste des tissus testés dans l'étude :

cerveau, testicules, foie, rein, poumon, côlon, muscle squelettique, rate, cellules épithéliales thymiques corticales, cellules épithéliales cutanées