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Que signifie l'organisation et l'attribution dans l'annotation de séquence ?

Que signifie l'organisation et l'attribution dans l'annotation de séquence ?



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S'il vous plaît quelqu'un pourrait-il m'expliquer ces lignes d'une manière simple

Ces séquences ont ensuite été arrangées en fonction de certaines régions chevauchantes présentes dans celles-ci. Cela nécessitait la génération de fragments chevauchants pour le séquençage. Ces séquences ont ensuite été annotées et attribuées à chaque chromosome

Que signifient « arranger » et « assigner » dans ce contexte ?

Source : NCERT classe 12 (Ce texte fait référence à la méthode développée par Frederick Sanger)


Le mot « arrangé » signifie simplement un alignement de séquence basé sur des régions se chevauchant dans deux séquences. Par exemple:

Séq1 : AGTGTCCGTCGTAAGTCA Séq2 :GTCGTAAGTCATCGAGATACC

menant à:

Seq12 : AGTGTCCGTCGTAAGTCATCGAGATACC

Peut-être a-t-il utilisé le mot "arranger" car le chevauchement détermine la direction de la séquence résultante (pour laquelle l'alignement des mots est suffisant)

Affectation : consiste simplement à diviser la séquence du génome selon les chromosomes de l'espèce. Comme par exemple, s'il s'agit de la séquence du génome humain et que le premier chromosome a une longueur de 2 50 000 pb (juste une hypothèse - je ne me souviens pas du chiffre exact), alors les 250 000 premiers nucléotides de la séquence seront "affectés" au chromosome 1. À partir de 2 50 001 jusqu'au chromosome 2 et ainsi de suite…


Voir la vidéo: Les composantes de lorganisation - Mintzberg Management (Août 2022).